Otrzymany olej po procesie tłoczenia i wstępnym oczyszczeniu na separatorze sitowym wymaga przeprowadzenia procesu filtracji oleju czyli oczyszczenia oleju z bardzo drobnych cząsteczek makuchu zawieszonego w oleju. Najprostszym sposobem filtracji jest sedymentacja polegająca na swobodnym opadaniu na dno zbiornika cząstek zawieszonych w oleju w wyniku siły ciążenia. Po procesie sedymentacji następuje zlewanie oleju znad osadu. Należy podkreślić, że sposób ten prowadzi do strat i zmiany parametrów jakościowych oleju. Proces sedymentacji oleju stosowany jest przez producentów wytwarzających olej zimno tłoczony na własne potrzeby. W procesach przemysłowych stosowana jest technologia filtracji polegająca na przepływie oleju przez siatkę filtracyjną filtra płytowego, na której osadzają się drobne cząsteczki wytłoku zawieszone w oleju. Tworzący się placek filtracyjny na siatce pozwala na otrzymywanie klarownego czystego oleju. W czasie filtracji następuje przyrastanie placka filtracyjnego na siatce co w konsekwencji prowadzi do konieczności oczyszczenia filtra z placka i rozpoczęcia filtracji od nowa.

Proces filtracji oleju w zależności od wolumenu może odbywać się na filtrach płytowych, w których oczyszczanie z placka filtracyjnego odbywa się ręcznie bądź automatycznie. Filtrowanie zwane potocznie polerowaniem oleju polega na przepuszczeniu oleju przez worki filtracyjne lub wkłady filtracyjne o oczkach 1 mikrona.

Bez obsługowy automatyczny filtr oleju firmy FARMET budowany na bazie filtra  AMAFILTER Holandia.